Представители Московского Патриархата расценивают отказ Синода Константинопольского Патриархата утвердить соглашение об урегулировании спора вокруг православных приходов в Эстонии как нарушение прав и дискриминацию русскоязычного населения этой страны, желающего сохранить духовные связи с Родиной. Представитель Русской Православной Церкви в интервью корреспонденту ИТАР-ТАСС сказал, что это перечеркивает договоренности, достигнутые на последней двусторонней встрече в Берлине.

Документ, подписанный Московским Патриархатом, должен был подтвердить существование в Эстонии двух параллельных юрисдикций: Константинопольской и Московской. А также отказаться от взаимных претензий на имущество, которым де-юре владеет каждая из сторон.

Принятие такого соглашения, заявил Патриарх Алексий на встрече с представителями русских общин СНГ и Балтии, могло бы поставить точку в затянувшемся конфликте в Эстонии. Ведь принадлежность многих православных приходов здесь до сих пор не урегулирована, поскольку власти отказываются зарегистрировать две одинаковые, на их взгляд, православные юрисдикции. Патриарх Алексий выступил против регистрации эстонских приходов Московского Патриархата как новообразованных, без права владения исторически принадлежащим им имуществом.

Проект соглашения Константинопольский Патриархат направил на рассмотрение своей юрисдикции в Эстонии. Этой немногочисленной структуре предоставлен статус автономной Православной Церкви. В то же время приходы Эстонской апостольской православной Церкви Московского Патриархата, составляющие 90-95 процентов от общего числа, рассматриваются лишь как подворья (представительства) РПЦ в Эстонии, с чем Московский Патриархат никогда не согласится.