Собор Эстонской Православной Церкви Московского Патриархата обратился в министерство внутренних дел Эстонии с просьбой о гражданской перерегистрации и восстановления правопреемственности. Это обращение является очередной попыткой Православной Церкви добиться от властей признания ее прав на собственность, принадлежавшую ей до 1940 года.

Конфликт начался в 1993 году, когда официальные власти зарегистрировали под именем Эстонской Православной Церкви так называемый Стокгольмский синод - раскольничью группировку, возникшую после Великой Отечественной войны. В 1996 году, вопреки всем церковным канонам, Стокгольмский синод был принят в общение Константинопольским патриархатом. После чего Русская Православная Церковь была вынуждена приостановить церковное общение с Константинополем. После долгих и трудных переговоров Русская Православная Церковь, желая сохранить церковный мир, пошла на компромисс, согласившись на сосуществование двух параллельных юрисдикций на одной канонической территории. Однако этот жест добрый воли был использован эстонскими властями и Константинопольским Патриархатом для захвата храмов уже как бы на законных основаниях. Стокгольмский синод никогда не имел на территории Эстонии ни приходов, ни прихожан.

"Совершая свое служение в мире, - указывается в обращении, - Церковь не может не заботиться и о внешних условиях своей законной деятельности на земле своего Отечества. Мы со всей ответственностью заявляем, что, находясь в канонической юрисдикции Московского Патриархата, сознаем себя членами Поместной Эстонской Церкви, автономия которой предоставлена Русской православной Матерью-церковью в 1920 году во дни патриаршества Святителя Тихона и подтверждена в 1993 году грамотой Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексия Второго, нашего эстонского соотечественника". Исходя из этого, Собор Эстонской Православной Церкви считает необходимым признать за ее приходами право быть преемниками единой церковной структуры, имевшей в 1935 году наименование "Эстонская Апостольско-православная Церковь".